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北京百泰派克生物科技有限公司

从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关技术服务。

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蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

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产品品牌百泰派克

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更新日期2021-09-05 23:09

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商品信息

基本参数

品牌:

百泰派克

所在地:

北京

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有效期至:

长期有效
详细说明

百泰派克生物结合MALDI-TOF质谱系统与LC-MS/MS质谱系统,提供**准确的蛋白胶点、胶条、IP样品,CO-IP样品蛋白鉴定服务。可鉴定的样品包括:1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条,2DE PAGE中的蛋白胶点,蛋白表达产物,免疫共沉淀(Co-IP)样品。其中,蛋白质样品的鉴定前处理过程严格按照Nature Methods发表的文章:Universal sample preparation method for proteome analysis进行,保证鉴定试验中得到更高的肽段覆盖率。质谱鉴定的原理则是基于鸟**法(Shot-gun):将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索**根据二级质谱信息与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。

蛋白质质谱鉴定流程

鸟**法(shot-gun)LC-MS的蛋白鉴定流程
基于鸟**法(shot-gun)LC-MS的蛋白鉴定流程

关于样品

1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品:
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验;
2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容,我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验:
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
3. 银染的样品请不要进行脱色处理

液体样品(In solution format):
1. 假如样品中蛋白量>10ug,我们对样品的缓冲体系没有要求;
2. 假如样品中蛋白量<10ug,样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用,并注意降低盐浓度;
3. 提交样品过程中,注意提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量;

Co-IP样品:
1. 如果您洗脱的样品需要跑胶,请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可;
2. 如果您直接提交洗脱样品,我们推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 缓冲体系进行蛋白洗脱,保证洗脱缓冲体系与后续的质谱实验兼容;

样品运输:
1. 我们推荐您将样品冻干后进行运输,冻干样品中蛋白非常**。
2. 液体样品推荐干冰运输,短途运输冰袋也可以。

注意事项: 利用质谱进行蛋白样品的鉴定,在样品准备过程中需佩戴手套和头套,尽量避免自身角蛋白(keratin)对样品的污染。

研究案例

该项目是中国科学院生物物理所一位老师将她的Co-IP的样品寄给我们进行蛋白鉴定。得到的部分结果如下图所示:

蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例
蛋白质胶点鉴定、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例

从图中客户看出,我们提供的结果报告中包含鉴定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鉴定出的肽段信息,鉴定出的肽段的修饰信息以及对鉴定到的蛋白的详细描述。

中/英文项目报告:

在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 鉴定的蛋白质详细信息

蛋白胶点、胶条、IP样品质谱鉴定一站式服务

您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告


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