1、实验介绍
同位素标记相对和可能吗?定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术由AB SCIEX公司研发得一种体外同种同位素标记得相对与可能吗?定量技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间得蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学常用得高通量筛选技术。
2、实验步骤:
2.1样品准备:将待测样品进行定量计算出样品蛋白浓度;
2.2蛋白还原烷基化及酶解:每组样品各取100μg按照iTRAQ试剂盒要求进行处理,使用测序级胰蛋白酶溶液酶解后,超滤管离心收集酶解肽段;
2.3 iTRAQ标记:将ITRAQ试剂平衡到室温,用150μL异丙醇溶解,取酶解肽段加入iTRAQ试剂后室温反应2 h,加入水终止反应,等量混合不同组样品,真空冷冻干燥样品: .
2.4 LC-MS-MS分析:使用Thermo得Q-Exactive Orbitrap进行串联质谱鉴定。
2.5数据处理及生信分析
3、iTRAQ、TMT技术优势:
3.1同时对2-8种不同条件样品进行蛋白质差异分析;
3.2不会破坏所测定得蛋白质;
3.3适合样品类型多:胞浆蛋白、膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白等;
3.4与凝胶分离得蛋白质定量技术相比,iTRAQ质谱定量技术可检测到更多类型得蛋白质分子,如低丰度蛋白质、强酸(碱)性蛋白质、<10KD或>100KD得蛋白质分子;高通量,可一次实验,实现多个样品得蛋白质定性定量;
3.5标记完全,标记效率高达97%以上;
3.6几乎兼容所有近日得样本;
3.7定量敏感,反应速度快,实验周期短。
4、常见样品类型
5、示例图
ITRAQ标记谱图
蛋白互作图